از اول، محل اصلی قبر شریف حدود 5 متر پایین تر از ضریح بوده و در اثر ساخت و ساز و خیابان کشی ها و سطح سازی اطراف حرم و ضریح قبر شریف گود واقع شده بود لذا دور آن را دیوار چیده اند که طبیعتا به صورت اتاقی درآمد و روی آن را از همان قدیم سقف زدند و ضریح را در سطح بالا که هم سطح رواق ها و صحن های فعلی است نصب نمودند. پس اخیرا زیر ضریح را خالی نکردند بلکه اطراف آن اتاق قدیمی زیر را مخصوصا از جانب بالای سر شریف توسعه داده و خالی نمودند و قبر شریف امام رضا کاملا در آن اتاق زیرزمینی معلوم و مشخص است که دارای کاشی کاری و سنگ قدیمی است (داخل سالنی که اخیرا به صورت زیرزمین ساخته اند دالانی هست که به آن اتاق راه دارد ولی درب آن بسته است).ضمنا هیچ اختلافی راجع به محل دفن آن حضرت وجود ندارد. گرچه قبر مطهر هیچ امام معصومی تا به حال نبش نشده است.
البته کیفیت قبر بسیاری از امام زاده ها و ائمه اطهار به همین شکل در سطح پایین تری واقع شده است مانند حضرت معصومه(س) و حضرت سیدالشهدا(ع) و ابالفضل العباس(ع) و البته این طور نبوده که از اول آن بزرگان را در سرداب دفن کنند بلکه همان طور که گفته شد در اثر توسعه حرم و ساختمان سازی و سطح سازی اطراف حرم ها خود به خود به این شکل درآمده.
البته کیفیت قبر بسیاری از امام زاده ها و ائمه اطهار به همین شکل در سطح پایین تری واقع شده است مانند حضرت معصومه(س) و حضرت سیدالشهدا(ع) و ابالفضل العباس(ع) و البته این طور نبوده که از اول آن بزرگان را در سرداب دفن کنند بلکه همان طور که گفته شد در اثر توسعه حرم و ساختمان سازی و سطح سازی اطراف حرم ها خود به خود به این شکل درآمده.